一、综合科：负责市中心的行政事务、经费使用、人事和劳动工资、文秘和档案工作；负责信访、宣传报道工作；负责机要保密等工作；完成领导交办的其他工作。

二、业务管理科：负责全市住房公积金制度建立、政策制定、宣传工作；负责缴存、提取和贷款等业务日常管理和服务协调工作；完成领导交办的其他工作。

三、会计科：负责全市住房公积金统一财务管理和会计核算工作；完成领导交办的其他工作。

四、信息科（客服中心）：负责全市住房公积金信息管理系统的建设、运行维护和安全管理工作；负责“12329”服务热线、“民意通”和网站等公众政策咨询服务工作；完成领导交办的其他工作。

五、稽查科：负责对违反《住房公积金管理条例》的单位进行行政执法；负责投诉、举报的处理;负责起诉、应诉及行政复议；负责电子监察和周报；开展定期内部审计和日常稽核工作；负责中心的风险管理工作。